《嘉峪关魏晋墓壁画》牧畜
《齐民要术》卷六记载了饲养牛、马、驴、骡、羊、猪、鸡、鹅、鸭、鱼等家禽、家畜的方法，尤其重视种畜的人工选育，书中指出：种禽畜躯体的大小，羽毛的深浅对其后代的优劣有着直接的关系。以选鸡种为例，要选秋冬生的鸡作种，这种鸡“形小，浅毛，脚细短者是也，守窠，少声，善育雏子”[17]。而春夏生的鸡，形状大，羽毛光泽，脚粗长，“游荡饶声，产乳易厌，既不守窠，则无缘蕃息也”[18]。
《嘉峪关魏晋墓壁画》配种
同时，《齐民要术》已经认识到了母畜孕期的环境条件以及幼畜生长地的生态条件和环境，对于动物的发育和生长有着巨大的影响。以选羊种为例，书中指出最好是留腊月和正月里生的羊羔作种。不在这几个月里出生的羊羔，毛是焦卷的，骨骼也细小，这是因为天气或寒或热的缘故。秋季生的羊羔，母羊虽然肥壮，但是到了冬天，母乳已竭，而青草还未生长，小羊发育不佳；夏季生的羊羔，此时虽然青草茂美，但是羊羔还小，不能吃草，经常饮的是热乳，发育亦不佳。而“其十一月及二月生者，母（羊）既含重，肤躯充满，草虽枯，亦不羸瘦；母乳过尽，即得春草，是以极佳也”[19]。在这里，贾思勰充分地考察了气候、环境对动物生长发育的影响，提出了注意孕期环境、留取优良品种的方法。此外，《齐民要术》对马、驴杂交所生出的骡的生物优势，以及禽兽去势可催肥的认识亦较以前更加深入。书中还辑录了兽医处方48例，涉及外科、内科、传染病、寄生虫病等各种病症，是我国现存最早的兽医药学知识的记载。《齐民要术》提出了对病畜要及早发现、预防隔离、注意卫生和积极治疗等正确主张，并介绍了直肠掏结术和疥癣病的治疗方法。这些方法历经1400多年，至今仍在沿用，是我国古代畜牧科学的宝贵遗产。